Złotoryja posiada oczyszczalnię ścieków (obecnie, mechaniczno-biologiczna oczyszczalnia ścieków, oczyszcza 5.800 m3, docelowo może przyjąć 14.500 m3/dobę). Ujęcia wody pitnej dla miasta wykorzystywane są w 40%.

Prawie połowa wody tłoczonej do sieci wodociągowej kwalifikuje się do grupy wód mineralnych. Zaopatrzenie Złotoryi w wodę realizuje Regionalne Przedsiębiorstwo Komunalne Sp. z o.o. ze studni głębinowych w Jerzmanicach Zdrój. Zasoby wody pochodzą z okresu geologicznego górnej oraz dolnej kredy i nie wymagają uzdatniania, spełniając wszelkie wymogi sanitarne dla wody pitnej.

Miasto w kompleksowy sposób rozwiązało problem gospodarki odpadami. Planuje się budowę punktu selektywnej gospodarki odpadami, który w sposób systemowy rozwiąże problem gospodarki odpadami komunalnymi.